Sinceramente, já vi algumas relações a distância darem certo, tipo, haver casamento, e futuramente alguém

ir morar na região do amor. Já tive algumas tentativas de relacionamento a distância, mas não deram por conta disso mesmo: a distância. Mas, não tão grande quanto você mencionou: era apenas 2:30 de avião, tipo moro em São Paulo e ela em Recife.
Agora, no seu caso que vc viu a pessoa por dois dias e tal, talvez, ali pode gerado um afeto ou um apego maior, o que ainda pode sustentar a relação ser a distância, apesar do pouco tempo que vcs se viram pessoalmente, como você disse.
Se vocês tem plano de morarem juntos, tipo, voce ir morar com ele, ou ele com você, de constituírem uma família, e se já estão a tanto tempo juntos, três anos, vale a pena sim manter esse relacionamento.

Particularmente, já não optaria por conhecer e manter um relacionamento a distância com uma pessoa, questão de que a pessoa não poderia estar perto de você frequentemente, não saberia se ela estaria se relacionando com outra pessoa (isso, claro, dependendo da confiança que tiver com ela), Chato você ter um relacionamento com pessoa mas não poder curtir o carinho dela, sair com ela e tals. A presença da pessoa é muito importante para você.