Um ateu de verdade (diferente de um ex crente revoltado) não deixa de ter uma
cerimônia inclusive na igreja só por ser ateu, afinal ele simplesmente não acredita, apenas ver aquilo como um simbolismo, um teatro, mas não demonstra nenhuma aversão a igreja ou coisas do gênero, isso se ele for um ateu convicto, né, então isso não seria um grande problema pra ele. Agora a questão de ideias é sim um ponto relevante e pra ser levado em consideração, considerando que o cristão de verdade tem um posicionamento diferente sobre relacionamento, tem que viver sob os mandamentos divinos em todas as áreas da vida, portanto seria bastante complicado se relacionar com alguém que pensa o contrário. Em um namoro já deve ser difícil, em um casamento então... Relacionamento é duas pessoas, os dois tem que estar em sintonia, um teria que ceder de alguma forma. Por fim, respondendo sua pergunta, eu fugiria de ter algo sério com alguém que ver a vida de uma maneira tão diferente de mim, já que não estaria disposta a ceder sobre os meus ideias