No início vocês passaram por uma espécie de luto, no qual sentiram falta da rotina

que tinham, embora não estavam felizes, te aconselho a se manter firme, isso é normal.
Em relação as crianças sejam extremamente responsáveis, decidam a guarda das crianças e a pensão (se tiver) na justiça. Isso irá evitar de problemas futuros ou conflitos.
Parabéns por terem atitude de separar, pois um lar infeliz prejudica o desenvolvimento saudável das crianças.