Existem duas coisas que podem ser confundidas usando a palavra intuição.
1. Instinto: tem coisas que

a gente percebe e a razão não consegue entender o porquê. Quando alguma pessoa fica chateada, por exemplo - às vezes você percebe mas nem consegue explicar por que você percebeu - só percebeu. Às vezes funciona pra coisas mais complexas ainda, em algumas situações de perigo, por exemplo, e é aí que entra a confusão com a magia/misticismo - pois geralmente é difícil entender como o corpo percebeu que você estava em uma situação de perigo antes do cérebro se dar conta.
2. Vidência/magia: essa não existe mesmo. É confundida com uma das duas: o instinto, como eu disse acima, ou a pura coincidência.
Resumindo - eu acho que existe sim, só é muito mal interpretada.