Não sei pelo mesmo motivo que eu tenho o cabelo naturalmente castanho claro mas as

minhas sobrancelhas e pestanas são escuras.

Muito provavelmente é pq o cabelo das sobrancelhas e das pestanas é mais curto. Por exemplo eu conhecia um moço que tinha sempre o cabelo pente 2 ou assim, depois uns anos mais tarde eu vi o rapaz com o cabelo pelo pescoço e percebi que ele tinha cabelo castanho claro mas com pente 2 parecia castanho normal/castanho escuro.