Eu nunca quis trabalhar CLT.
Até hoje só trabalhei de forma autônoma. O problema é

que se você não paga nenhum tipo de seguro trabalhando autônomo você está ferrado. Eu já me ferrei. 3 mêses de atestado para poha nenhuma.
Já tive CNPJ também, quando vendia na SHOPEE. Porém a política de fretes foi alterada drasticamente ao longo do tempo, o que inviabilizou a continuidade de uma parte significativa dos vendedores que moram em cidades do interior.
Depender estritamente de um comércio para viver no Brasil é tenso, logo logo você está careca de tanta preocupação. Rsrs..
Voltei para o trabalho autônomo, encerrei o CNPJ. Não vendo + nada.

A melhor coisa para o brasileiro médio é ser concursado.