O que responder quando um homem diz que estava pensando na gente?

Se for recíproco, vai saber responder!

Depende, você está interessada nele? Então dê uma resposta positiva no contexto da sua conversa. Isso dependerá do seu interesse e diálogo com ele.
Não está interessada? desbararina/muda de assunto.

Pergunte o que ele estava pensando.