O certo seria "choveram ateus na festa". Chover nessa frase está sendo usado no sentido conotativo, ou seja, tem sujeito (ateus) e tem que concordar com ele.
"Ateus" é o sujeito da sua frase e o verbo chover está sendo empregado em sentido figurativo, logo flexiona.
Choveu quando literal é impessoal, mas quando figurado (no sentido de cair) concorda com o sujeito.
"Se o sujeito existe, o verbo não deveria concordar com ele?"
Jesus, é o verbo vivo que desceu do céu, eis o motivo de não concordar com os ateus.
Brinks!
Foi só para descontrair.