É uma frase irônica.
É quando a sua opinião não importa para a pessoa, e dai ela manda essa para desmerecê-la.
Um exemplo:
Você está em um grupo de amigos e eu me junto posteriormente a vocês, chegando lá, eu chego todo arrumado e tal, só que você vem e me fala que eu sou feio.
Como para mim a sua opinião não tem relevância, eu digo que "vindo de você é um elogio". Ironia.