Vou começa o curso de computação EAD. Estudar em casa sempre foi o diferencial, mesmo que vc faça um curso presencial. Sempre foi assim para concursos, sempre foi para os primeirões dos vestibulares.
Acredito que cursos EAD se tornarão mais frequentes no futuro. O único problema é a baixa interação com professor/turma e falta de aulas presenciais. No entanto, vc ganha em flexibilidade e custo (eu gosto de estudar finais de semana). A depender do curso não há tanta perda assim. Curso de teatro, por exemplo, precisa mesmo de aulas práticas. Computação nem tanto.
Diploma hoje em dia já não conta tanto, portanto não acho que um avaliador vai pegar no seu pé por vc ter feito curso a distância, mas sim por vc não ter desenvolvido alguma outra habilidade. E não acho que haja menção a isso no diploma. É um diploma normal.