Eu não me incomodaria, definitivamente não, mas, por exemplo, se você é mulher e se considera homem, e fez todos os procedimentos para se tornar um homem, para quê vai querer usar o banheiro das mulheres? Pois tecnicamente, você é um homem agora, e quer se portar e ser tratado como um homem, então eu imagino que usar o banheiro feminino não seja mais necessário para eles, e isso é até um passo importante para a aceitação das outras pessoas. Para mim tanto faz, faça o que mais se sentir confortável, eu vou respeitar da mesma forma.