Faz diferença sim. Um número maior de pás faz o escoamento se conformar melhor à geometria do rotor, que aumenta a energia transferida ao fluído. Na prática, para um ventilador de jato aberto, aumenta a vazão.
Existem considerações específicas sobre fator de deficiência de potência, que aumenta quando o número de pás aumenta (e isso é bom), mas um número de pás também estrangula o escoamento, reduzindo a vazão, mas isso é problema do engenheiro.
Há outro ponto a se considerar sobre o número de pás. Para ventiladores domésticos, um número par é viável por causa da rotação mais baixa, mas na prática os ventiladores axiais terão um número ímpar para evitar ressonância e fadiga.