O sexo é, sem dúvidas, masculino, porém, o gênero pode ser feminino ou masculino pq se refere ao conceito de como a pessoa se identifica.. tem gente que se identifica mulher mesmo que biologicamente seu sexo seja masculino.
Aí entra a diferença de sexo e gênero. Sexo é biológico e gênero é construção social, por isso aceita a identificação. Então sim, se a pessoa se identifica como homem, esse é o gênero dela, mesmo que o sexo seja diferente.