Depende, ele só manda um bom dia e depois some o dia todo? Ou às vezes ele volta a tarde/noite para conversar seguidamente contigo? Se só fica no bom dia todos os dias, deve ser frescura dele, apenas dizendo que "lembrou" sem sentido algum, provavelmente deve mandar pra geral. Agora, se ele manda esse bom dia, mas mais tarde ele retorna para conversar contigo, ai é só sinal de lembrança mesmo. Tipo "Tenha bom dia, depois a gente conversa", enfim, depende de um todo.
Talvez a intenção do "Bom dia" seja apenas para demonstrar que lembrou de você e não que queira ficar conversando naquele momento, passe a responder com um Bom dia apenas.
O fato ele te dar bom dia não quer dizer nada, apenas que lembrou de ti, deve estar mandando para outras pessoas também. Eu recebo bom dia dos meus amigos pelo whats todos os dias e eu apenas respondo com um bom dia e pronto, não fico esperando retorno pra iniciar uma conversa.
O fato de apenas mandar um "bom dia" não quer dizer que a pessoa que te mandou queira iniciar uma conversa naquele momento e sim que o que realmente está escrito ali, te desejando que tenhas um dia bom nada mais que isto.