Eu não uso esse termo e inclusive ele é usado por várias mulheres também.
Já pensei que pode ser porque a mulher está recebendo e os movimentos são feitos pelo homem com o pênis, então veem como ele que está "comendo" na linguagem de quem usa esse termo. Dever daí que surgiu essa ideia, mas nos dias de hoje é bem comum a mulher também fazer esses papel, ficando por cima.
Eu pensava dessa forma desde que entendi como o sexo funciona. Se a vagina da mulher "come" o pênis ereto durante a relação sexual, por que usa-se a expressão "comer a mulher"? Era para ser o contrário.
A explicação mais sensata é que comer uma mulher significa saciar a fome de fazer sexo com ela. Quando o pênis fica ereto, sentimos uma sensação de comichão e formigamento insuportável que faz a gente querer penetrar a vagina para saciar essa vontade, como se fosse uma fome.