Qm é ruim em matemática consegue cursar análise de sistemas?

Claro que consegue, mas vai ter mais dificuldade do que os outros que tem mais afinidade com a matemática.
Se você tem dificuldade nessa área, faça um curso pra melhorar; Diferente da escola, você não obrigado a fazer nada, e se sentir muito pressionado é só desistir.