Os pontinhos pretos são pretos mesmo? Olha se não é sangue coagulado. A microbiota se enfraqueceu por causa do antibiótico, mas não et eliminada dessa forma. Se não é casca de feijão, pode ser coágulo de sangue. Neste caso procure um médico o quanto antes.
Depende. Não sou médica pra dar diagnóstico. Mas sei que fezes pretas ou melena tem a ver com sangue/hemorragia no trato alto digestório (duoedono/estomago/esôfago), faça exame de sangue oculto nas fezes, acho que pode sanar sua dúvida caso isso persista