Nenhum dos dois é melhor ou pior, cada um tem suas vantagens e desvantagens e tem indicações para quadros específicos.
Em alguns casos, é melhor inclusive uma radiografia ou uma colonoscopia do que algum desses dois, e às vezes é preciso uma associação entre esses exames ou nenhum desses exames, apenas bastando a anamnese. Depende do estágio da doença do paciente também.