Claro. Se ler um autor indiano vai virar hindu? se ler A Arte da Guerra vai virar confucionista, budista etc? Precisa ler mais e formar sua própria opinião. Filosofia se absorve, se critica, concorda, discorda, não é seita pra aceitar 100% o que alguém diz.
Nietzsche acreditava em Deus. A famosa frase "Deus está morto" não é sinônimo de "Deus não existe". Afinal, só o que existe morre. Para ele, deus é como uma pessoa, que nasceu, cresceu, ficou velho e morreu. E como Deus morre? Com a modernidade, o homem o matou e o trocou por um novo (porém mais fraco), a ciência virando o pilar da razão/moral, algo que estava em alta graças à moda do pensamento iluminista. Ele atacava o falso moralismo e o coitadismo dos cristãos de meia tigela, não a religião em si (inclusive o antissemitismo para ele não passava de ressentimento). Compaixão era pra ele parasitismo da dor do outro. Desse papinho de coitado que apequena o homem, surgiu a vontade de poder e transcendência, daí o conceito de Super-homem. Viver além das limitações racionais, religiosas, morais, indo além disso através da Vontade de Potência.
Na verdade ele era um grande crítico da falsa moral em geral. Seja na religião, ciência, até no nacionalismo.
"Alemanha, Alemanha, cuidado com a mentalidade de rebanho". O cara no século XIX já previa o gado.
Pode ler tranquilo. Aprenda, se supere e sem falsa modéstia. Saca o sumário do Ecce Homo: