Tem de ter sido as bactérias, os vírus precisam de células pra parasitar, depositar seu material genético usando assim a maquinaria molecular da células pra se reproduzir...
Mas de alguma oura forma, que ng sabe, também pode ter sido vírus, menos provável...
Acredito que as bactérias vieram primeiro, afinal, os vírus precisam de células para se desenvolverem; logo, é necessário que haja a existência das bactérias antes de tudo.