Bonita é que ela não era!
Pra começar, ela teve varíola na infância, e por esse motivo ficou com o rosto todo marcado. Naquela época não tinha todo esse monte de tratamentos estéticos que temos hoje, então já viu.
"Dona Leopoldina, uma de suas noras, que casou com Dom Pedro I, Imperador do Brasil, quando a viu pela primeira vez, achou-a tão feia que: [...] baixou os olhos como não querendo voltar a vê-la; as marcas da varíola, o corte de cabelo, cordões e mais cordões de pérolas e pedras preciosas enroladas em seus cabelos, pendendo de seus cachos gordurosos como cobras..."
Fonte: https://www.fafich.ufmg.br/pae/colonia/cinema/CarlotaJoaquina/Biografias/Aparencia.htm
Fora os problemas advindos dos casamentos consanguíneos, realizados nas dinastias reais durante séculos (vide Carlos II da Espanha).
Tem dois fatores:
O pessoal antigamente não era tão bom em fazer retratos fiéis. Poucos conseguiam.
Tem aquele pianista francês, Chopin, os retratos dele são horríveis e a foto dele é até comum pra época.
O pessoal desse tempo não tinha conhecimento pra se cuidar tanto como a gente e fora que eles tinham umas modas muito diferentes.
Então é possível sim.