Temos escolhas até que se prove o contrário, e não há prova de que a nossa agência (esse é o nome que se dá à ação humana no tempo e no espaço) seja determinada por elementos materiais.
O que se pode afirmar é que ela é restrita (não basta eu querer voar para eu poder voar, há evidentemente restrições materiais/físicas para o que eu posso fazer), mas daí dizer que somos completamente determinados a uma ação é um salto lógico.
Ainda que todo fenômeno tenha uma explicação física, biológica, química (fisiológica), neurológica, essas explicações só respondem a uma das 4 causas aristotélicas, a causa material, mas ignoram a causa eficiente e causa final, que são metafísicas.