Pode sim, pode acontecer de atrapalhar ou não seu ciclo, pois são hormônios que iniciou e parou, poder pode sim, a partir do momento que parar já não está mais protegida, lembre-se.
Eu não tomo mais anticoncepcional me senti muito mal, eu uso o aplicativo "Meu Calendário" e da o dia certinho que vou menstruar e o dia que vou ficar fértil muito bom, fora que meu corpo sempre me da sinais, quando mais ou menos vai descer mas use camisinha sempre